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Dr.-Ing. Jochen Schmid

Wissenschaftlicher Mitarbeiter

Dr.-Ing. Jochen Schmid
Dr.-Ing. Jochen Schmid

Wissenschaftlicher Mitarbeiter

Tel.: +49 (0) 9421 187-331
Fax: +49 (0) 9421 187-310
E-Mail: j.schmid@tum.de [12]

TUM Campus Straubing
Schulgasse 16
94315 Straubing

Schulgasse 16 [13] Raum: 1.A06

Vita

Lebenslauf:

  • Forschungsaufenthalt bei CONICET/PROIMI, Tucumán, Argentinien (2015)
  • Kurzaufenthalte an der Universidade Nova de Lisboa und University of Copenhagen (2013)
  • Zukunftsforum Biotechnologie der DECHEMA (Sprecher seit 2013)
  • Seit 2012 Habilitation im Bereich der Mikrobiellen Polymere
  • Forschungsaufenthalt an der Keio Universität in Japan (2012)
  • Seit 2010 Gruppenleiter der Abteilung Metabolic Engineering & Mikrobielle Polysaccharide am Lehrstuhl für Chemie Biogener Rohstoffe.
  • Seit 2009 Postdoc am Lehrstuhl für Chemie Biogener Rohstoffe
  • Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut für Mikrobiologie und Genetik der TU-Berlin (2008-2009)
  • Promotion am Institut für Mikrobiologie und Genetik der TU-Berlin (2005-2008) zum Thema „Genetics of Scleroglucan Production by Sclerotium rolfsii“ bei Prof. Stahl und Vera Meyer
  • Diplomarbeit an der Charité Berlin, Campus Virchow Klinikum Experimentelle Chirurgie (2005)
  • Studium der Biotechnologie an der Technischen Universität Berlin (1998-2005)
  • Ausbildung zum Brauer und Mälzer bei der Gold Ochsen GmbH in Ulm (1996-1998)

Forschung:

  • Synthetische Biosynthesecluster für mikrobielle Polysaccharide
  • Synthetische Chemo-Enzymatische Kaskaden-Reaktionen
  • Aufklärung der Biosynthese mikrobieller Polysaccharide
  • Untersuchung fungaler Enzymsysteme
  • Genom Editierung
  • Metabolic Engineering

Publikationen:

    1. Schmid, J., Divining sugar substrates. Nature Chemical Biology, 2018. 14(12): p. 1071-1072.
    2. Harnisch F, Blombach B, Buyel J, Centler F, Classen T, Ebert BE, Eyer C, Dohnt K, Grünberger A, Jandt U, Jung S, Kara S, Regestein L, Schmid J, Tischler D, Wierckx N. Revisionsbedürftig? Rechte und Pflichten akademischer Nachwuchsführungskräfte. Forschung & Lehre 2018, Ausgabe 09/18
    3. Schmid, J., Recent insights in microbial exopolysaccharide biosynthesis and engineering strategies. Current Opinion in Biotechnology, 2018. 53: p. 130-136.
      doi:10.1016/j.copbio.2018.01.005 [14]
    4. Rütering, M., J. Schmid, M. Gansbiller, A. Braun, J. Kleinen, M. Schilling, and V. Sieber, Rheological characterization of the exopolysaccharide Paenan in surfactant systems. Carbohydrate Polymers, 2018. 181: p. 719-726.
      doi:10.1016/j.carbpol.2017.11.086 [15]
    5. Rütering, M., B. F. Cress, M. Schilling, B. Rühmann, M. A. G. Koffas, V. Sieber, and J. Schmid, Tailor-made exopolysaccharides—CRISPR-Cas9 mediated genome editing in Paenibacillus polymyxa. Synthetic Biology, 2017. 2(1): p. ysx007-ysx007.
      doi:10.1093/synbio/ysx007 [16]
    6. Funk I, Sieber V, Schmid J (2017) “Effects of glucose concentration on 1,18-cis-octadec-9-enedioic acid biotransformation efficiency and lipid body formation in Candida tropicalis.” Scientific Reports 7(1): 13842.
      doi:10.1038/s41598-017-14173-7 [17]
    7. Funk I, Rimmel N, Schorsch C, Sieber V, Schmid J (2017) Production of dodecanedioic acid via biotransformation of low cost plant-oil derivatives using Candida tropicalis, Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, 1-12
      doi: 10.1007/s10295-017-1972-6 [18]
    8. Koenig S, Rühmann B, Sieber V, Schmid J (2017) Quantitative Assay of β-(1,3)–β-(1,6)–Glucans from Fermentation Broth Using Aniline Blue. Carbohydr Polym.
      doi.org/10.1016/j.carbpol.2017.06.047 [19]
    9. Schmid J, Harnisch F (2017) Das neue Wissenschaftszeitvertragsgesetz: Intention und Status quo!?
      BioSpektrum 23(2):119-119
      doi: 10.1007/s12268-017-0773-9 [20]
    10. Harnisch, F. and J. Schmid (2017) From emergence to consolidation or peaks: Riding the waves of bioengineering.
      Engineering in Life Sciences:17(1): p. 4-5.
    11. Loscar ME, Huptas C, Wenning M, Sieber V, Schmid J (2016) Draft Genome Sequence of Lysinibacillus xylanilyticus SR-86. Genome Announcements, 4(6):e01317-01316.
      doi:10.1128/genomeA.01317-16 [21]
    12. Pick A, Beer B, Hemmi R, Momma R, Schmid J, Miyamoto K, Sieber V (2016) Identification and characterization of two new 5-keto-4-deoxy-D-Glucarate Dehydratases/Decarboxylases. BMC Biotechnology. 16(1): p. 80.
    13. Schmid J, Huptas C, Wenning M (2016) Draft Genome Sequence of the Xanthan Producer Xanthomonas campestris LMG 8031. Genome Announcements 4(5).
    14. Rütering M, Schmid J, Rühmann B, Schilling M, Sieber V (2016) Controlled production of polysaccharides – exploiting nutrient supply for levan and heteropolysaccharide formation in Paenibacillus sp.. Carbohydrate Polymers 148, 326-334.
    15. Rühmann B, Schmid J, Sieber V (2016) Automated Modular High Throughput Exopolysaccharide Screening Platform Coupled with Highly Sensitive Carbohydrate Fingerprint Analysis. J Vis Exp, 110(e53249).
      doi:10.3791/53249 [22]
    16. Spiekermann A, Schmid J (2016) Damit sie wissen, was sie tun – Constructive Alignment soll zielgerichtetes Lernen fördern. Deutsche Universitäts Zeitung, 04/16.
    17. Schmid J, Farina J, Rehm B, Sieber V (2016) Editorial: “Microbial Exopolysaccharides: From genes to applications”. Frontiers in Microbiology, 7.
      doi 10.3389/fmicb.2016.00308 [23]
    18. Schmid J, Heider D, Wendel N.J, Sperl N, Sieber V (2016) Bacterial Glycosyltransferases: Challenges and opportunities of a highly diverse enzyme class toward tailoring natural products. Frontiers in Microbiology, 7.
      doi.org/10.3389/fmicb.2016.00182 [24]
    19. Blombach B, Castiglione K, Haarmann T, and Schmid J (2015) Trends in der Genomeditierung für die industrielle Biotechnologie. BIOspektrum 21(7): 788-790.
    20. Schmid J, Muffler K (2015) Grüne Gentechnologie – der Ratio eine Chance. BIOspektrum 2(4): 367-367.
    21. Rühmann B, Schmid J, and Sieber V (2015) Methods to identify the unexplored diversity of microbial exopolysaccharides. Frontiers in Microbiology 6.
      doi 10.3389/fmicb.2015.00565
    22. Schmid J, Sieber V and Rehm B (2015) Bacterial exopolysaccharides: Biosynthesis pathways and engineering strategies. Frontiers in Microbiology 6.
      doi 10.3389/fmicb.2015.00496 [25]
    23. Pick A, Schmid J and Sieber V (2015) Characterization of uronate dehydrogenases catalysing the initial step in an oxidative pathway. Microbial Biotechnology. doi: 10.1111/1751-7915.12265
    24. Schmid J and Sieber V (2015) Enzymatic Transformations Involved in the Biosynthesis of Microbial Exo-polysaccharides Based on the Assembly of Repeat Units. ChemBioChem.
      doi: 10.1002/cbic.201500035 [26]
    25. Reese J d, Sperl N, Schmid J, Sieber V and Plank J (2015) Effect of biotechnologically modified alginates on LDH structures. Bioinspired, Biomimetic and Nanobiomaterials 1-34.
      10.1680/bbn.14.00032 [27]
    26. Rühmann B, Schmid J and Sieber V (2015) High throughput exopolysaccharide screening platform: From strain cultivation to monosaccharide composition and carbohydrate fingerprinting in one day. Carbohydrate Polymers 122(0): 212-220.
      doi:10.1016/j.carbpol.2014.12.021 [28]
    27. Schmid J, Sieber V (2014) Weiße Gentechnologie – Von Vitaminen & Aromen zu Industriechemikalien Band 8 der Schriftenreihe Gentechnik für Umwelt und Verbraucherschutz – 5. Fachtagung Gentechnik. pdf [29]
    28. Schmid J, Sperl N, Sieber V (2014) A comparison of genes involved in sphingan biosynthesis brought up to date. Appl Microbiol Biotechnol:1-15.
      doi:10.1007/s00253-014-5940-z [30]
    29. Pick A, Ott W, Howe T, Schmid J, Sieber V (2014) Improving the NADH-cofactor specificity of the highly active AdhZ3 and AdhZ2 from Escherichia coli K-12. Journal of Biotechnology (0).
      doi:10.1016/j.jbiotec.2014.06.015 
    30. Schmid J, Koenig S, Pick A, Steffler F, Yoshida S, Miyamoto K, Sieber V (2014) Draft Genome Sequence of Kozakia baliensis SR-745, the First Sequenced Kozakia Strain from the Family Acetobacteraceae. Genome Announcements 2 (3).
      doi:10.1128/genomeA.00594-14 [31].
    31. Bühler FH B, Junker B, Junne S, Kuepfer L, Mao L, Marienhagen J, Muffler K, Noack S, Olbrich C, Rihko-Struckmann L, Schallmey A, Schmid J, Stafforst T, Steingroewer J, Zurbriggen M (ed) (2014) Biotechnologie – der Schlüssel zur Bioökonomie. Dechema Diskussionspaper Vol 1.
      doi:http://biotech.dechema.de/Publikationen.html [32]
    32. Ruhmann B, Schmid J, Sieber V (2014) Fast carbohydrate analysis via liquid chromatography coupled with ultra violet and electrospray ionization ion trap detection in 96-well format. Journal of chromatography A 1350:44-50.
      doi:10.1016/j.chroma.2014.05.014
    33. Schmid J, Koenig S, Rühmann B, Rütering M, Sieber V (2014) Biosynthese und Genomik mikrobieller Polysaccharide. Biospektrum 20 (3):288-290. doi:10.1007/s12268-014-0443-0
    34. Pick A, Rühmann B, Schmid J, Sieber V (2012) Novel CAD-like enzymes from Escherichia coli  K-12 as additional tools in chemical production. Appl. Microbiol. Biotechnol
      doi:10.1007/s00253-012-4474-5 [33].
    35. Schmid J, Meyer V, Sieber V (2011) Scleroglucan: Biosynthesis, production and application of a versatile hydrocolloid. Appl. Microbiol. Biotechnol.: 91(4):937-947.
    36. Schmid J, Müller-Hagen D, Bekel T, Funk L, Stahl U, Sieber V, Meyer V (2010) Transcriptome sequencing and comparative transcriptome analysis of the scleroglucan producer Sclerotium rolfsii. BMC Genomics 11:329.
    37. Schwartlander R, Schmid J, Brandenburg B,Katenz E, Wolfgang F, Vondran F, Pless G, Cheng X.D, Pascher A, Neuhaus P, Sauer I.M (2007) Continuously microscopically observed and process-controlled cell culture within the SlideReactor: Proof of a new concept for cell characterization. Tissue Engineering, 13, 187-196.
    38. Schwartlander R, Schmid J, Katenz E, Cheng X, Pless G, Modest D, Vondran F, Neuhaus P, Sauer I.M (2006) The slidereactor – Proof of concept. International Journal of Artificial Organs, 29, 519-519.
    39. Sauer I.M, Schwartlander R, Schmid J, Efimova E, Vondran F.W.R, Kehr D, Pless G, Spinelli A, Brandenburg B, Hildt E, Neuhaus P (2005) The SlideReactor – A simple hollow fiber based bioreactor suitable for light microscopy. Artificial Organs, 29, 264-267.

Buchartikel 

  1. Schmid, J. and V. Sieber, The Bacterial Glycome: From Monomers to Complex Carbohydrate Polymers, in Reference Module in Life Sciences. 2019, Elsevier.
  2. Schmid, J., B. Rühmann, V. Sieber, L. Romero-Jiménez, J. Sanjuán, and D. Pérez-Mendoza, Screening of c-di-GMP-Regulated Exopolysaccharides in Host Interacting Bacteria, in Host-Pathogen Interactions: Methods and Protocols, C. Medina and F.J. López-Baena, Editors. (2018), Springer New York: New York, NY. p. 263-275.
  3. Clavel T, Mendez D.F, Schmid J, Kolossa S, Matzke L (2015) Das interdisziplinäre Forschungsseminar; Erkenntnisse aus dem Pilotprojekt INDISNET. In: Neues Handbuch Hochschullehre, Ausgabe 72, Signatur E1.11, (Hrsg.) Behrend, Fleischmann, Schaper, Szczyrba, Wildt
  4. Schmid J, Mueller-Hagen D, Sieber V, Meyer V (2013). Nucleic and Protein Extraction Methods for Fungal Exopolysaccharide Producers. In: Laboratory Protocols in Fungal Biology. V. K. Gupta, M. G. Tuohy, M. Ayyachamy, K. M. Turner and A. O’Donovan, Springer New York: 427-434.
  5. Schmid J, Stahl U, Meyer V (2009) Genetic and Metabolic Engineering in Filamentous Fungi. In: Physiology and Genetics. The Mycota Vol 15: 377-392.

 

 

 

 

 

 

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